También jugó en la Supercopa de Europa que se disputó en el Stade Louis II en Mónaco y en donde encajó cuatro goles en la derrota del Chelsea por 4-1 frente al Atlético de Madrid, campeones de la Liga Europea. El Chelsea no falló ante el Qarabag y al Atlético de Madrid le tocaba ganar a la Roma para aferrarse al milagro. La partida de Wojciech Szczęsny a préstamo a la Roma puso a Čech como primera elección en el equipo por encima de David Ospina. Al ganar la Liga de Campeones, Čech se convirtió en el cuarto futbolista checo en lograrlo. Chelsea obtuvo la victoria por 1-0 sobre la Juventus de Turín en la Liga de Campeones, camiseta del atletico de madrid 2021 siendo este el partido número 200 de Čech desde que se unió al club. Čech sufrió una lesión en la pantorrilla durante la pretemporada con el Chelsea, una reaparición de la misma lesión que sufrió ante el Inter de Milán la temporada anterior. El mes siguiente, el 23 de diciembre de 2007, tuvo que ser sustituido en un partido frente al Blackburn Rovers debido a una lesión en la cadera.
Čech consiguió su 170.º arco en cero en la Premier League, en la victoria por 2-0 al AFC Bournemouth el 28 de diciembre de 2015, consiguiendo un nuevo récord de liga, el que pertenecía a David James. El 29 de mayo de 2012, Čech fue incluido en el equipo que disputaría la Eurocopa 2012 a celebrarse en Polonia y Ucrania. ↑ Álvaro Olmedo (28 de mayo de 2011). «¡ ↑ «Igual que ellos». El 15 de enero de 2019 anunció que se retiraría al final de la temporada tras veinte temporadas en activo. En mayo de 2013, Čech ganó la Liga Europea cuando el Chelsea derrotó al SL Benfica en la final. El 27 de febrero de 2010, Čech sufrió una lesión en el músculo de la pantorrilla en un encuentro de Liga de Campeones frente al Inter de Milán. El entrenador del Chelsea, José Mourinho, culpó a Hunt de la lesión de Čech, diciendo que la manera en que disputó el balón fue una «desgracia».
Así, con la defensa local muy adelantada, demasiado, el sevillano José Antonio Reyes aprovechó el ‘agujero’ habitual de los locales en el lateral derecho para darle el 0-1 a José Manuel Jurado (min. ↑ a b «El Celta de Vigo despide a Antonio Mohamed y contrata a Miguel Cardoso». ↑ a b Pattenden, Mike (8 de agosto de 2009). «The greatest save of my life: The day Chelsea’s Petr Cech almost died». ↑ «Brankář Čech si hlídal, aby mu rekord neutekl». Čech comenzó la temporada 2009-10 en buena forma con el Chelsea, derrotando al Manchester United en la final de la Community Shield en Wembley. A pesar de haber concedido el gol más rápido en la historia de una final de FA Cup, Čech ayudó al Chelsea a llevarse el trofeo de FA Cup frente al Everton FC. Čech se sometió a una cirugía menor en su hombro el 27 de junio de 2006 para reparar una larga lesión que había derivado de la temporada anterior.
Sufrió una lesión de pantorrilla el 2 de marzo de 2016 en el encuentro contra el Swansea. En una entrevista para Chelsea TV, Čech dijo que no recordaba nada de la lesión en sí. El 11 de marzo de 2018, Čech se convirtió en el primer guardameta de la Premier League en mantener el arco en cero 200 veces, fue en el encuentro contra el Walford donde además atrapó un penalti de Troy Deeney. Durante ese mes, Čech volvió a la titularidad en la Premier League, frente al Newcastle United de local, y luego ante el Swansea City de visita, mantuvo el arco en cero en ambos encuentros. Chelsea comenzó la temporada 2008-09 en buena forma, encajando solamente siete de 17 goles y manteniendo 11 porterías imbatidas, 10 de las cuales fueron con Čech en el arco. Čech acabó la temporada salvando un penal frente al Portsmouth en la final de la FA Cup, permitiéndole al club retener su título de copa y así conseguir su primer doblete doméstico.